Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Gm28038F7BCN9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Gm28038F7BCN9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Gm28038F7BCN9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Gm28038F7BCN9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Gm28038F7BCN9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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