Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms