Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms