Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Gm10378F6XQQ1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Gm10378F6XQQ1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Gm10378F6XQQ1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Gm10378F6XQQ1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Gm10378F6XQQ1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Gm10378F6XQQ1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Gm10378F6XQQ1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Gm10378F6XQQ1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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Gm10378F6XQQ1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
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