Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms