Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms