Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms