Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC005561E9Q5E2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms