Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm17175E9Q528 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm17175E9Q528 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm17175E9Q528 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm17175E9Q528 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17175E9Q528 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm17175E9Q528 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17175E9Q528 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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