Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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Tarbp1E9Q368 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
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Tarbp1E9Q368 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
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Tarbp1E9Q368 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
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Tarbp1E9Q368 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
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Tarbp1E9Q368 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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Tarbp1E9Q368 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
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Tarbp1E9Q368 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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