Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms