Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms