Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm3298E9PW80 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3298E9PW80 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3298E9PW80 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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