Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3002E9PW72 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms