Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG4

Crisp4, Cysteine-rich secretory protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp4E9PVG4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp4E9PVG4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms