Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc62E9PVD1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc62E9PVD1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms