Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc175E9PVB3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms