Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1110002E22RikE0CYV9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1110002E22RikE0CYV9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms