Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms