Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms