Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms