Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms