Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20547B8JJN0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Gm20547B8JJN0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm20547B8JJN0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm20547B8JJN0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm20547B8JJN0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm20547B8JJN0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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