Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms