Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rd3lB2RV38 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms