Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms