Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms