Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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