Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Znf518aB2RRF6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf518aB2RRF6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms