Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Trabd2bB1ATG9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Trabd2bB1ATG9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Trabd2bB1ATG9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms