Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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H2-M5A7VMS3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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