Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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Atp8b5A3FIN4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Atp8b5A3FIN4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Atp8b5A3FIN4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Atp8b5A3FIN4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Atp8b5A3FIN4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Atp8b5A3FIN4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Atp8b5A3FIN4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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