Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trgv2A2J008 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms