Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Samt1A2BED8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Samt1A2BED8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Samt1A2BED8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Samt1A2BED8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Samt1A2BED8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Samt1A2BED8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Samt1A2BED8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samt1A2BED8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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