Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms