Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Rtf1A2AQ19 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Rtf1A2AQ19 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Rtf1A2AQ19 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Rtf1A2AQ19 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Rtf1A2AQ19 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Rtf1A2AQ19 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Rtf1A2AQ19 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Rtf1A2AQ19 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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