Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms