Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Frmpd1A2AKB4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms