Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn6A2AJB9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms