Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ckap5A2AGT5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ckap5A2AGT5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ckap5A2AGT5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ckap5A2AGT5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ckap5A2AGT5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ckap5A2AGT5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ckap5A2AGT5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap5A2AGT5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap5A2AGT5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap5A2AGT5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap5A2AGT5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap5A2AGT5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap5A2AGT5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap5A2AGT5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap5A2AGT5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap5A2AGT5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap5A2AGT5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap5A2AGT5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap5A2AGT5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap5A2AGT5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap5A2AGT5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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