Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

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Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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