Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.05■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms