Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms