Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fbf1A2A870 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fbf1A2A870 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fbf1A2A870 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fbf1A2A870 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fbf1A2A870 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbf1A2A870 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms