Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

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Length 1,177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Nlrp1bA1Z198 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Nlrp1bA1Z198 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Nlrp1bA1Z198 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nlrp1bA1Z198 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms