Protein–RNA interactions for Protein: A1Y9I9

Tomt, Transmembrane O-methyltransferase homolog, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TomtA1Y9I9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TomtA1Y9I9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms