Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Scn2aA0A0J9YTW6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Scn2aA0A0J9YTW6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Scn2aA0A0J9YTW6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Scn2aA0A0J9YTW6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Scn2aA0A0J9YTW6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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