Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csmd2V9GX34 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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