Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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