Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer1Q9Z2Y3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Homer1Q9Z2Y3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms